いいえ、全く別物とお考えください。

将来的にＮＰＯ法人になるという考え方ではなく、最初からＮＰＯ法人で行くか、一般社団法人を設立するかの選択です。

ＮＰＯ法人、社団法人ともに公益認定はありますので、事業内容に合わせて形態を選ばれるとよいと思います。